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巨大分子の超並列分子動力学法シミュレーションに関する研究
林亮子[著]
[目次]
- 要旨
- 目次 / p1
- 1 緒言 / p1
- 1.1 本研究の背景 / p1
- 1.2 本研究の目的 / p3
- 1.3 本論文の構成 / p5
- 2 分子動力学法シミュレーション / p7
- 2.1 はじめに / p7
- 2.2 分子動力学法の概要 / p8
- 2.3 シミュレーション結果を表す物理量 / p21
- 2.4 シミュレーション結果の可視化手法 / p26
- 2.5 分子動力学法の並列化手法 / p37
- 2.6 まとめ / p41
- 3 ドメイン分割法を用いた分子動力学法の並列シミュレーション / p43
- 3.1 はじめに / p43
- 3.2 3次元シミュレーションにおけるドメイン分割法 / p46
- 3.3 ドメイン分割法のシミュレーション実行時間の理論解析 / p50
- 3.4 メッセージ通信型計算機上の最適ドメイン形状 / p60
- 3.5 まとめ / p74
- 4 動的負荷分散を考慮した分子動力学法の並列シミュレーション / p76
- 4.1 はじめに / p76
- 4.2 動的負荷分散法 / p78
- 4.3 動的負荷分散法の性能評価 / p84
- 4.4 計算負荷の平均化効率と計算負荷集中の大きさとの関係 / p92
- 4.5 まとめ / p99
- 5 分子動力学法による直鎖高分子の並列シミュレーション / p101
- 5.1 はじめに / p101
- 5.2 直鎖分子モデル / p102
- 5.3 並列化手法 / p105
- 5.4 ドメイン分割法と分子分割法の並列化性能 / p112
- 5.5 鎖片割り当てドメイン分割法の並列化性能 / p117
- 5.6 まとめ / p126
- 6 結言 / p127
- 6.1 本論文のまとめ / p127
- 6.2 今後の課題 / p130
- 謝辞 / p131
- 本研究に関する発表論文 / p137
「国立国会図書館デジタルコレクション」より
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書名 |
巨大分子の超並列分子動力学法シミュレーションに関する研究 |
著作者等 |
林 亮子
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書名ヨミ |
キョダイ ブンシ ノ チョウヘイレツ ブンシ ドウリキガクホウ シミュレーション ニ カンスル ケンキュウ |
出版元 |
林亮子 |
刊行年月 |
1998.2 |
ページ数 |
vii,138枚 |
大きさ |
30cm |
NCID |
BA38630901
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言語 |
日本語 |
出版国 |
日本 |
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